Probabile che non sia la centralina in se, (qualche dubbio mi rimane però) ma qualche cavo lungo il cablaggio che ha avuto qualche interruzione o danno da sbalzi di tensione derivati appunto dall'acqua che la centralina ha preso.

Prima di tutto controlla i pin dei connettori che vanno alla centralina, puliscili e ingrassali, vedrai ceh sono anneriti sicuramente, se ossidati ancora peggio..magari è solo quello (te lo auguro).
Step successivo è verificare ogni singolo filo del cablaggio, ti ci vuole un elettrauto con un buion tester e molta pazienza. Spesso la centralina dalla obd trasmette un errore in questi casi, digitalo se esce e cerca su internet, tempo fa trovai pure un ragazzo che aveva avuto un problema simile e spiegava pure quale cavo cambiare.

in bocca al lupo..